Kauno liuteronų parapija įkurta 1558 metais.
Kertinis dabartinės bažnyčios akmuo padėtas 1682-ais metais rugsėjo 22 dieną.
Nuo 1683-ųjų metų pamaldos laikomos, per Šv. Kalėdas pašventintoje naujoje Šventos Trejybės bažnyčioje.
1860-1862 metais pristatomas bažnyčios bokštas ir pastatoma klebonija.
1953.03.30 Palmių (Verbų) sekmadienio pamaldos tapos paskutinėmis, nes sovietų valdžia parapijos veiklą uždraudė, o bažnyčią ir kitus parapijai priklausančius pastatus nacionalizavo.
Per 25-rius metus visi bažnyčios statiniai paverčiami griuvėsiais.
1978 metais pradėti bažnyčios ir kitų išlikusių parapijos pastatų atstatymo darbai.
Po 36-rių metų (1989.04.30) įvyko pirmosios pamaldos bažnyčioje, oficialiai gražintos 1992 metų spalio 8 dieną.
Projektas „Sutelkime Centro seniūnijos bendruomenę kitaip”, finansuojamas socialinės apsaugos ir darbo ministerijos lėšomis, pagal 1.1.5 priemonę „Stiprinti bendruomeninę veiklą savivaldybėse” Kauno m. savivaldybėje 2020 m.
Šiuo sudėtingu pandeminiu laikotarpiu mums pavyko: apjungti Centro seniūnijos bendruomenę, įgyvendinti tikslą, jautriai paliečiantį mus visus, mūsų istoriją. Paroda ne tik virtuali, ją galima pamatyti Kauno liuteronų Švč. Trejybės bažnyčioje, aišku, po karantino. Dėkojame Centro seniūnijos nuostabiai bendruomenei, Larisai Liapinai, klebonui Sauliui Juozaičiui, forografei Akvilei Keturakytei, Daivai Štarevičiūtei, Centro seniūnijos seniūnaičiams palaikiusiems šią idėją.
